微波殺菌設備是利用了電磁場的熱效應和生物效應的共同作用的結果。該微波殺菌設備的特點如下；
1.節約能源：一般常規熱力殺菌往往在環境及設備上存在熱損失，而微波是直接對食品進行作用處理，不會產生額外的熱能損耗，相比較而言，更節約電能。
2.殺菌均勻：常規熱力殺菌是從物料表面開始，然后通過熱傳導傳至內部，因此存在內外溫差。為了保持食品風味，縮短處理時間，導致食品內部沒有達到足夠溫度而影響殺菌效果。而微波具有穿透作用，對食品進行整體處理時，表面和內部都同時受到作用，因此，殺菌均勻。